Au niveau de la comptabilité, le CPE/BC doit tenir et conserver les livres, comptes et registres exigés par le Ministre de la manière qu’il le prescrit (LSGEE, article 57).
Le CPE/BC doit conserver des pièces justificatives (LSGEE, article 57) pendant 6 ans tous les registres et les livres de comptes relatifs à̀ l’octroi et à l’affectation des subventions reçues.
Le CPE/BC est aussi sujet à une suspension, diminution et annulation de la subvention (LSGEE, article 97) si absences des pièces justificatives, non-respect de l’entente de subvention, des règles budgétaires, des règles de reddition de compte ou des règlements adoptés en vertu d’une Loi.
Dans le cas où le CPE/BC fait l’objet d’une pénalité administrative, si celle-ci n’est pas acquittée dans les délais prévus, le Ministère peut la déduire de la subvention de fonctionnement à venir (LSGEE, article 101.15).